مسجد کبود در زمان حکومت ابوالمظفر جهانشاه از سلسله‌ی ترکمانان قره‌قویونلو در سال ۸۷۰ هجری قمری به همت و نظارت جان بیگ خاتون همسر جهانشاه ساخته شد. مسجد کبود تبریز که به دلیل کاربرد سنگ فیروزه در بخش های مختلف آن به فیروزه جهان اسلام معروف است. در میات گردشگران خارجی به مسجد آبی نیز شهرت دارد.
بنابر کتیبه موجود بر سر در ورودی، مسجد کبود در گذشته بخشی از مجموعه ای با نام مظفریه بوده که شامل ساختمان هایی چون مدرسه، مسجد، خانقاه و کتابخانه بوده است و در زمان رونقش به عنوان مسجدی تشریفاتی مورد استفاده قرار میگرفته است. با این حال تقدیر روزگار چیز دیگری بود و این عمارت به همراه دیگر بناهای مجموعه سلنتی مظفریه تبریز در حادثه زمین لرزه سال ۱۱۵۸ شمسی ( ۱۷۸۰ میلادی ) تخریب شد. از خود مسجد چیزی کمتر از ٢۰ درصد باقی ماند اما دیگر بناها به صورت کامل نابود شدند.